Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSRP2Q16527 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSRP2Q16527 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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