Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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