Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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