Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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