Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms