Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NEDD8Q15843 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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