Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC85BQ15834 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC85BQ15834 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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