Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms