Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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