Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EBI3Q14213 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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