Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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COL4A6Q14031 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL4A6Q14031 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL4A6Q14031 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
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