Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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