Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDH18Q13634 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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