Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms