Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
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