Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC1Q13547 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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