Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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MKRN4PQ13434 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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MKRN4PQ13434 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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MKRN4PQ13434 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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