Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE3BQ13370 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms