Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK5R2Q13319 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDK5R2Q13319 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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