Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms