Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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IFT88Q13099 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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IFT88Q13099 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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IFT88Q13099 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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