Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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