Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXF2Q12947 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF2Q12947 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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