Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms