Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGEF5Q12774 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF5Q12774 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms