Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE4DQ08499 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE4DQ08499 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms