Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms