Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms