Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms