Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
EMX2Q04743 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EMX2Q04743 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms