Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms