Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1DQ01668 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms