Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNB1P98172 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms