Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB1P82279 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB1P82279 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB1P82279 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB1P82279 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB1P82279 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB1P82279 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms