Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P63121 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms