Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms