Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP25P60880 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms