Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NRG3P56975 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NRG3P56975 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms