Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASP9P55211 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms