Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms