Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA3P52797 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms