Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNQ1P51787 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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