Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms