Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TTPAP49638 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TTPAP49638 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TTPAP49638 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TTPAP49638 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TTPAP49638 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TTPAP49638 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TTPAP49638 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TTPAP49638 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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