Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLMP48507 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLMP48507 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms