Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ME1P48163 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ME1P48163 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ME1P48163 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ME1P48163 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ME1P48163 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ME1P48163 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms