Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDKN1BP46527 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms