Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RANGAP1P46060 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms