Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGFBR1P36897 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms