Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms